La Presidencia Pro-Témpore (PPT) es designada por consenso de los Paises Miembros de la Conferencia durante la Reunión Viceministerial. Los países interesados en asumirla lo deben anunciar en la Reunión Plenaria al menos un año antes de asumirla. Actualmente, la PPT está a cargo del Gobierno de Belice y la ostenta la señora Tanya Santos-Neal, Directora General, Ministerio de Hacienda, Desarrollo Económico, Inversión, Economía Azul y Aviación Civil, e Inmigración.

Entre sus principales funciones se encuentran:

1. Facilitar la coordinación de las reuniones de la Conferencia Regional sobre Migración (CRM) y del Grupo Regional de Consulta sobre Migración (GRCM).
2. Efectuar la convocatoria y efectuar, a través de la Secretaría Técnica, las invitaciones correspondientes para los eventos de la CRM.
3. Asumir la coordinación y dirección general de las reuniones y actividades de la CRM que se efectúen durante su período cuando así corresponda.
4. Asumir la coordinación y dirección general de las reuniones y actividades del GRCM y de los Grupos de Trabajo establecidos dentro de la CRM: Grupo de Trabajo sobre Gestión Fronteriza, Grupo de Trabajo sobre Migración Laboral, Grupo de Trabajo sobre Migración Irregular y Masiva y el Grupo de Trabajo sobre Protección.
5. Preparar los informes de los Grupos de Trabajo, un documento de Conclusiones y Recomendaciones a los(as) Viceministros(as), y un borrador de Declaración y Decisiones según los acuerdos consensuados durante la Reunión Plenaria de la CRM, respectivamente, y que serán aprobados en sus respectivas instancias.
6. Determinar, en consulta con los Países Miembros, las actividades prioritarias identificadas en el Plan Estratégico que se encuentren pendientes y que requieren financiamiento para realizarlas.
7. Asume algunas obligaciones sobre la administración del fondo para el retorno de migrantes en situaciones de alta vulnerabilidad.